Okyanuslardaki en yaygın organizma DNA’sında bir virüsü barındırıyor

Okyanuslarda ve muhtemelen tüm gezegende en yaygın organizma, SAR11 adı verilen tek hücreli deniz bakterileri ailesidir. Bu sürüklenen organizmalar minik jöle tanelerine benziyor ve okyanuslardaki kıt kaynaklar için diğer bakterilerle rekabet etmek için evrimleşti.

Artık bu organizma grubunun DNA’larında virüs barındırma yeteneğine rağmen – veya belki de – yüzünden geliştiğini biliyoruz. Mayıs ayında Nature Microbiology‘de yayınlanan bir çalışma, viral hayatta kalma stratejileri hakkında yeni bir anlayışa yol açabilir. Washington Üniversitesi oşinografları, Pelagibacter veya SAR11 olarak bilinen deniz suyuna hakim bakterilerin benzersiz bir virüse ev sahipliği yaptığını keşfetti. Virüs, zamanının çoğunu konakçının DNA’sında geçiren, ancak bazen diğer hücrelere bulaşmak için çıkar ve potansiyel olarak konakçının genetik materyallerinden bir kısmını da taşır.

Bu virüsün iki yönlü hayatta kalma stratejisi, diğer organizmalarda bulunanlardan farklıdır. Virüs, konakçının DNA’sında gizlenir ve hücreler bölünürken kopyalanır, ancak hala iyi anlaşılmayan nedenlerle, hem çoğalır ve hem de diğer hücrelerden serbest bırakılır.

Yeni çalışma, SAR11 hücrelerinin% 3’ü, virüsün hücre çoğalmasına ve bölünmesine veya parçalanmasına neden olabileceğini göstermektedir-bir konakçının genomunda yaşayan çoğu virüsünkinden çok daha yüksek bir yüzde. Bu, çok sayıda serbest virüs üretir ve hayatta kalmasının anahtarı olabilir. Çalışma, diğer ortamlarda konak-virüs etkileşimlerini netleştirmeye yardımcı olabilecek temel araştırmaları teşvik edebilir.

UW oşinografi grubu 2019 yılında SAR11 de dahil olmak üzere deniz fitoplanktonlarının kükürt kullanımını inceleyen bir makale yayınlamıştı. Bu, araştırmacıların okyanuslarda yaşayan organizmanın iki yeni suşunu geliştirmelerine ve en son genetik tekniklerle NP1 suşunu analiz etmelerine izin verdi.

 

Araştırmacı Kelsy Cain, Temmuz 2017 araştırma gezisi sırasında Oregon kıyılarından örnekler topladı. Deniz suyunu birkaç kez seyreltti ve daha sonra laboratuvardaki örnekleri büyütmek için kükürt içeren bir madde kullandı – deniz suyunda var olmayı tercih eden organizmalar için zor bir süreç.

Ekip daha sonra bu suşun DNA’sını Seattle’daki UW PacBio merkezinde sekansladı. Fakat, bir virüsün genomu sekanslama işlemini karmaşıklaştırdığını buldular. Sonra bu virüsün sadece bu suşta olmadığını keşfettiler. NP2 kontrol kültürünü büyütmeye başlamışlardı ki, virüsü yine gördüler. Virüsten kurtulamamış olmaları şaşırtıcıydı.

Deneyleri, virüslerin hücreleri çoğaltmayı ve kendisini serbest bırakmayı seçmesinin, hücreler besinlerden yoksun bırakıldığında daha aktif gerçekleştiğini ve konakçı hücrelerin% 30’una kadar parçalandığını gösterdi. Araştırmacılar, virüslerle dolaşan bakteri genlerinin SAR11’in besin açısından fakir koşullarda rekabet avantajlarını korumalarına yardımcı olabileceğine inanıyorlar.

University of Washington. (2020, May 29). The most common organism in the oceans harbors a virus in its DNA. ScienceDaily. Retrieved May 30, 2020 from www.sciencedaily.com/releases/2020/05/200529150640.htm

 

 

 

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir